Yugi Moto es un niño de espíritu noble y gentil que recibe de su abuelo Salomon Moto un amuleto llamado El Rombecabezas del Milenio. Yugi es capaz de armarlo, sin saber que este hecho liberará extraños poderes anteriormente desconocidos para él. Hace 5 mil años los antigüos faraones egipcios solían tener duelos usando bestias míticas y seres mágicos.

Eventualmente, los faraones perdieron control de este gran poder y se desató el caos, hasta que un valiente faraón llamado Yami contuvo a las bestias con ayuda de los siete amuletos del milenio, uno de los cuales es ahora propiedad de Yugi.

En la época actual estos antigüos duelos han sido recreados en forma de un juego de cartas denominado Duelo de Monstruos, del cual existen campeonatos regionales, nacionales y mundiales debido a su popularidad.

Yugi ha recibido entrenamiento de su abuelo en este juego y ha llegado a dominarlo, gracias a que su abuelo le ha enseñado a confiar en el corazón de las cartas.

La posterior victoria Yugi sobre el campeón nacional Kaiba llega a oidos de Maximilian Pegasus, el creador del juego de cartas del duelo de monstruos. Poseedor de El ojo del Milenio, otro de los 7 amuletos, descubre que Yugi esta en posesión del Rompecabezas del Milenio y decibe ponerle una trampa para obtenerlo capturando el alma del abuelo de Yugi.

Es así como Yugi emprende una jornada en busca de recuperar el alma de su abuelo donde descubrirá los poderes ocultos de su Rompecabezas del Milenio y la lucha por el poder que despiertan estos amuletos, todo enmedio de duelos de cartas que pondrán a prueba su valor e ingenio.