La serie narra las aventuras de un joven samurai atrapado en el futuro donde todo es regido por Aku, un monstruo/demonio que puede adquirir cualquier forma y posee un poder casi ilimitado, y que solo puede ser herido por la espada del guerrero samurai.

Jack (apodado así por su primero contacto en el futuro, ya que su verdadero nombre nunca es revelado) busca la forma de volver en el tiempo a su época para poder vencer a Aku y evitar que su mal se propague y rija al mundo en el futuro (en la serie tiempo presente), debido a que éste último fué quién lo envió al futuro antes de que pudiera abatirlo en su tiempo (ahora el pasado).